Con un emozionante debutto nella Cavalleria rusticana di Mascagni nello storico allestimento di Liliana Cavani al Teatro Mikhailovskij di San Pietroburgo, Daniele Rustioni ha fatto a soli 24 anni il suo ingresso nella scena musicale internazionale. Acclamato dalla critica come una rivelazione, il giovane direttore è stato immediatamente nominato Principale Direttore Ospite della seconda scena lirica pietroburghese.
Rustioni ha compiuto gli studi musicali presso il Conservatorio “G.Verdi” di Milano dove si è diplomato a pieni voti in organo, composizione organistica, pianoforte, direzione d’orchestra. Si è perfezionato in direzione all’Accademia Superiore Musicale Pescarese, all’Accademia Musicale Chigiana di Siena (Diploma d'Onore) e alla Royal Academy of Music di Londra. Ha inoltre partecipato a masterclass con Sir Colin Davis, Kurt Masur e Gianandrea Noseda, che ne ha subito notato lo straordinario talento e ne è divenuto il principale mentore. Ha diretto l’Orchestra del Teatro Regio di Torino nel 2007 in un concerto con musiche di Mozart e nel 2008 per il debutto operistico in Italia con La bohème di Puccini nell’ambito del Festival estivo del Castello di Racconigi. Molto attivo all’estero, si è distinto in una serie di concerti alla guida della Russian National Philharmonic Orchestra di Mosca, dell'Orchestra Filarmonica Accademica di San Pietroburgo, della Welsh National Opera Orchestra al Covent Garden di Londra e in Italia dell'Orchestra della Toscana (ORT), del’Orchestra dell'Accademia del Teatro alla Scala, de "I Pomeriggi Musicali" e dell'Orchestra dell'Accademia del Festival "Settimane Musicali" di Stresa. Al Teatro Mikhailovskij di San Pietroburgo ha diretto nuove produzioni di Elisir d’amore – presentata in tournée al Teatro Bolshoj di Mosca - e Pagliacci (per la regia di Liliana Cavani), riprese di Rigoletto e La traviata, oltre a concerti lirico-sinfonici e alla Messa di Requiem di Verdi, che ha poi diretto alla Sala Grande della Filarmonica di San Pietroburgo. Nel corso della stagione 2008/09 è stato assistente di Antonio Pappano alla Royal Opera House, Covent Garden nell’ambito del progetto “Jette Parker Young Artists Programme”.
Nella stagione 2009/10 ha debuttato in Norma nell’ambito della stagione ASLICO, alla Fenice di Venezia ne Il barbiere di Siviglia, al Teatro Comunale di Bologna ne L’elisir d’amore e con l’Orchestra dell’Arena di Verona in un programma sinfonico. Nel maggio 2010 è tornato al Teatro Regio di Torino con La bohème e successivamente ha debuttato con l’Orchestra Haydn, che tornerà a dirigere nel dicembre 2011.
Dopo il suo impegno al Teatro alla Scala nel settembre 2010 nella ripresa della storica produzione di Jean-Pierre Ponnelle de L’occasione fa il ladro con l’orchestra e i cantanti solisti dell’Accademia scaligera, tornerà ai Pomeriggi Musicali. Nel novembre 2010 dirigerà una nuova produzione di Otello di Giuseppe Verdi nella messa in scena di Edmuntas Nekrosius, mentre nel dicembre 2010 dirigerà la Messa di Requiem con la Filarmonica di Helsinki.
Nella stagione 2010/11 farà il suo debutto alla Welsh National Opera con una nuova produzione di Così fan tutte e alla Royal Opera House di Londra con Aida.